Es el conjunto de microorganismos vivos que residen en nuestro intestino y que juegan un papel fundamental en diversas funciones que nos ayudan a mantener en buen estado nuestra salud gastrointestinal. Ciertos factores como la dieta, la ingesta de fármacos (antibióticos, antiácidos), los viajes, etc. pueden dar lugar a variaciones en la composición de la microbiota, con la consiguiente alteración de sus funciones y de nuestro estado de salud.